Moleculaire diagnostiek bij MPN
Het aantonen van de JAK2 V617F mutaties draagt in belangrijke mate bij aan het stellen van de diagnose polythemia vera (PV), essentiele trombocythemie (ET) en primaire myelofibrose (PMF).
Meer dan 90% van de PV patiënten hebben een JAK2 V617F mutatie. Een klein deel dat geen JAK2 V617F mutatie heeft, heeft mutaties in JAK2 exon 12.
Bij ET en PMF ligt de JAK2 V617F incidentie rond de 50%. Andere belangrijke mutaties worden in CALR en MPL gevonden. Deze komen in de regel niet samen voor en komen ook niet samen voor met de JAK2 V617F mutatie. De mutaties in CALR worden gevonden in exon 9 en resulteren in een netto +2 bp frameshift. De mutaties in MPL worden gevonden in codon 505 en 515.
De JAK2 V617F VAF ligt bij diagnose tussen de 1 en 100%.Net als bij de JAK2 V617F mutatie varieert de VAF bij JAK2 exon 12, CALR en MPL mutaties bij diagnose sterk. Sanger sequencing is daarom niet geschikt voor het aantonen van mutaties met een lage VAF.
Meer dan 90% van de PV patiënten hebben een JAK2 V617F mutatie. Een klein deel dat geen JAK2 V617F mutatie heeft, heeft mutaties in JAK2 exon 12.
Bij ET en PMF ligt de JAK2 V617F incidentie rond de 50%. Andere belangrijke mutaties worden in CALR en MPL gevonden. Deze komen in de regel niet samen voor en komen ook niet samen voor met de JAK2 V617F mutatie. De mutaties in CALR worden gevonden in exon 9 en resulteren in een netto +2 bp frameshift. De mutaties in MPL worden gevonden in codon 505 en 515.
De JAK2 V617F VAF ligt bij diagnose tussen de 1 en 100%.Net als bij de JAK2 V617F mutatie varieert de VAF bij JAK2 exon 12, CALR en MPL mutaties bij diagnose sterk. Sanger sequencing is daarom niet geschikt voor het aantonen van mutaties met een lage VAF.
Contactpersoon
dr. B. van der ReijdenFrequentie
1 rondes van 4 monstersAantal deelnemers
27Prijzen
Deelname
€ 613,34
Details
Alle in Nederland gevestigde laboratoria kunnen zich registreren voor deze rondzending.
Deze rondzending wordt één keer per jaar georganiseerd en bevat meerderde casus. Specifiek wordt gevraagd welke mutaties gevonden worden en wat de VAF daarvan is.
Ondersteunde bepalingen
CALR Mutatie |
CALR VAF |
JAK2 exon 12 mutatie |
JAK2 V617F |
MPL mutatie |
Methodelijst Moleculaire diagnostiek bij MPN
CALR Mutatie | Consensus methodegroep |
---|---|
ABL | Overall |
GUS | Overall |
Overig | Overall |
PBGD | Overall |
CALR VAF | Consensus methodegroep |
---|---|
ABL | Overall |
GUS | Overall |
Overig | Overall |
PBGD | Overall |
JAK2 exon 12 mutatie | Consensus methodegroep |
---|---|
ABL | Overall |
GUS | Overall |
Overig | Overall |
PBGD | Overall |
JAK2 V617F | Consensus methodegroep |
---|---|
ABL | Overall |
GUS | Overall |
Overig | Overall |
PBGD | Overall |
MPL mutatie | Consensus methodegroep |
---|---|
ABL | Overall |
GUS | Overall |
Overig | Overall |
PBGD | Overall |
Apparaten
Apparaat | Fabrikant |
---|---|
BioRad LightCycler | Bio-Rad |
GeneExpert | Cepheid |
ABI Prism 7000 | Life Technologies |
ABI Prism 7500 | Life Technologies |
ABI Prism 7700 | Life Technologies |
ABI Prism 7900 | Life Technologies |
Overige | Overigen |
Rotor Gene | Qiagen |
Roche LightCycler 1.0 | Roche Diagnostics |
Roche LightCycler 1.2 | Roche Diagnostics |
Roche LightCycler 2.0 | Roche Diagnostics |
Roche LightCycler 480 | Roche Diagnostics |
Vragen over deze rondzending?
Gebruik onderstaand formulier om ons een bericht te sturen.
"*" indicates required fields