Artsen en patiënten vertrouwen erop dat medische laboratoriumdiagnostiek steeds tot dezelfde antwoorden komt, ongeacht wanneer of waar een meting is gedaan. De SKML draagt daaraan bij door identieke onbekende materialen naar de deelnemende laboratoria te sturen en te vragen dit te onderzoeken zoals  men ook bij patiëntmateriaal doet. Dat wordt externe kwaliteitsbewaking genoemd omdat deze plaats vindt naast de interne kwaliteitsbewaking waarmee elk laboratorium zelf de constantheid van de eigen kwaliteit bewaakt.

Nadat de deelnemende laboratoria hun uitslagen en conclusies naar de SKML hebben gestuurd, maakt de SKML een rapport voor de deelnemers waarin ze hun uitslagen zien vergeleken met die van andere deelnemers en waar beschikbaar ook die van referentielaboratoria of andere experts. De deelnemende laboratoria gebruiken de rapporten als controle- en verbeterinstrument en de ervaring leert dat door deelname aan externe kwaliteitsbewaking programma’s de laboratoria beter gaan presteren en daardoor  ook de verschillen tussen laboratoria kleiner worden.

Middels ruim 130 rondzendingen draagt de SKML op deze wijze bij aan de kwaliteit van de pre-analytische, analytische of post-analytische fase van laboratoriumonderzoek.